Климат (Dfc) субарктический. Максимальная температура, наблюдается в июне до 30.0°С, а самая низкая до -33.3°C в январе. Месяц с самыми низкими температурами — январь, среднее суточное значение температуры -12.6 °C. Самый тёплый месяц — июнь со средним значением температуры 20.9 °C. Среднегодовая температура в Медвежьегорске, учитывая данные наблюдений, достигает 4.8°C. В рамках года: солнечных дней - 61, дни со снегом - 107, дни с дождем - 104, пасмурных дней - 94.