Климат (Dfc) субарктический. Месяц, когда температура наиболее высокая — июль со средней температурой 22.4 °C. Самый холодный месяц — январь, среднее значение температуры за день -17.6 °C. Вершина температурного диапазона, фиксируется в августе до 29.7°С, а самая низкая до -37.0°C в декабре. Средняя температура за год в Мегионе, в соответствии с наблюдениями, составляет 1.8°C. За год: ясные дни - 60, дни со снегом - 121, дождливых дней - 79, облачных дней - 106.