Климат (BSk) холодный полуаридный (степной). Средняя температура за год в Шагонаре, в соответствии с наблюдениями, достигает 3.2°C. Максимальная температура, замечается в июне до 37.3°С, а низшая понижается до -36.2°C в декабре. Месяц, когда температура наиболее низкая — январь, его средний дневной температурный уровень -21.9 °C. Месяц с самыми высокими температурами — июль с характерной температурой 23.2 °C. В течение года: солнечных дней - 40, снегопадные дни - 56, дождливых дней - 120, пасмурных дней - 150.