Климат (Dfc) субарктический. Наивысшая температура, отмечается в августе до 29.4°С, а низшая понижается до -36.2°C в январе. Месяц, когда температура наиболее низкая — январь, его средний дневной температурный уровень -14.4 °C. Месяц с самыми высокими температурами — август со средним значением температуры 19.4 °C. Средняя температура воздуха в Шенкурском р-н, исходя из данных наблюдений, составляет 4.0°C. В течение одного календарного года: ясные дни - 48, снегопадные дни - 100, дни с дождем - 122, пасмурных дней - 96.